彭德懷一行到南京后，先后找機關(guān)領(lǐng)導、教授會主任、戰(zhàn)役系的學員，以及副院長、副政治委員進行了交談。院長劉伯承不在南京，沒有交談。經(jīng)過調(diào)查和討論，他們認為：軍事學院自1950年成立以來，經(jīng)過全院同志的積極努力，克服困難，取得了許多工作成績。但是，他們也認為：在過去幾年的教學中，存在一個很大的缺點，就是教學工作中的“教條主義”相當嚴重。最主要的表現(xiàn)是教學內(nèi)容和中國的國情、軍情不大相適應。在教材和作業(yè)設定中，對于人民解放軍黨委集體領(lǐng)導和首長分工負責相結(jié)合的制度，對于人民解放軍的政治工作制度照顧少，多半是采用了“一長制”的精神。編寫教材和作業(yè)設定的根據(jù)，沒有注意人民解放軍現(xiàn)有的裝備技術(shù)條件以及最近可能達到的水平，而是把蘇軍已經(jīng)高度機械化了的裝備技術(shù)條件作為依據(jù)。在戰(zhàn)斗演習中，除了注意到一般地形條件下的攻防戰(zhàn)術(shù)之外，很少針對中國大部分沿海地區(qū)山地多、河流多、水田多的特點，忽視人民解放軍長期在復雜地形條件下所采用的滲透、穿插、迂回、包圍等戰(zhàn)術(shù)活動，把大部分演習都設想在一般起伏地帶，都設想為大規(guī)模的正面攻防戰(zhàn)。這樣教學的結(jié)果，一方面固然可以使干部取得一些現(xiàn)代技術(shù)條件下的戰(zhàn)爭規(guī)律知識，一方面也包含著一個危險，這便是一旦發(fā)生戰(zhàn)爭，人民解放軍就可能不會以劣勢的裝備去戰(zhàn)勝優(yōu)勢裝備的敵人，也可能不會在山地、水網(wǎng)、河川地帶行動作戰(zhàn)，將在戰(zhàn)爭初期遭受不必要的損失。

　　對于學院下一步的工作，彭德懷提出了建議：應當以講授學術(shù)和研究學術(shù)為中心任務；應當對人民解放軍的作戰(zhàn)經(jīng)驗給予充分的重視；繼續(xù)認真學習蘇軍的先進經(jīng)驗，應當貫徹民主作風和群眾路線。關(guān)于學習蘇軍問題，彭德懷強調(diào)：“應當明確，正確地學習蘇軍的經(jīng)驗不是教條主義。如果以為反對教條主義就是反對學習蘇軍經(jīng)驗，或者認為強調(diào)發(fā)揚我軍過去的有用經(jīng)驗，就可以不再學習蘇軍的先進經(jīng)驗和其他外國的軍事經(jīng)驗，那都是錯誤的。但是我們學習蘇軍的經(jīng)驗和其他外國的經(jīng)驗，是為了依據(jù)我軍的實際情況來更好地解決建軍和將來作戰(zhàn)問題，不是毫無目的的學習，不能為了學習就把我國我軍的實際情況加以夸大。因此，應當堅決貫徹結(jié)合實際的學習方針。在這個方針下，就全軍范圍來說，應當以學習蘇聯(lián)的軍事技術(shù)和合同戰(zhàn)術(shù)為重點，并且應當從我軍的現(xiàn)實情況出發(fā)�！�

　　這個報告，對軍事學院建院后取得的成績與存在的缺點的評價，顯然是不符合實際的。報告在肯定學院成績時，并沒有明確指出成績是主要的，只是說“取得了許多工作成績”。在批評學院缺點時，武斷地說“教學工作中的教條主義相當嚴重”。彭德懷并因此向軍事學院黨委提出：“應當展開反教條主義的工作�！泵珴蓶|對此表示同意。

　　1957年夏，“反右派”斗爭在全國展開。在全黨開展反右傾、反保守主義的大氣候下，軍隊反“教條主義”的工作中斷，代之而進行的是開始批判教育訓練中的“經(jīng)驗主義”。一些曾反對過“教條主義”、主張有選擇地學習蘇軍經(jīng)驗的人遭到批判。1958年3月，訓練總監(jiān)部召開四級干部會議，檢查、批判、肅清“保守思想影響”。訓練總監(jiān)部原副部長張宗遜、訓練總監(jiān)部院校部副部長孫毅、訓練總監(jiān)部院校部處長彭施魯?shù)热朔謩e被點名批判。由于缺乏實事求是，帶著情緒的揭批越批越離譜。開始給他們戴的帽子是“保守主義”、“經(jīng)驗主義”，后來竟然成了“修正主義”、“反蘇”、“右派”。

　　這種狀況持續(xù)時間不長，情況又發(fā)生了新的變化。1958年3月，毛澤東在成都主持召開有中央和地方部分領(lǐng)導人參加的工作會議。他在會議上提出要破除迷信、解放思想，強調(diào)學習要和獨創(chuàng)相結(jié)合，批判了過去8年經(jīng)濟工作中的“教條主義”，提醒大家注意吸取王明教條主義的教訓。毛澤東還指出，軍隊的工作落后于地方，要求通過軍委擴大會議以整風的方式來改變落后狀態(tài)。全軍在學習這次會議精神時，又回過頭來檢查和揭露軍事訓練工作中的“教條主義”問題。由于中蘇兩黨關(guān)系的惡化，學習蘇軍被當作“教條主義”的惡果，成為軍隊批判“教條主義”的活靶子。

　　1958年5月27日至7月22日，彭德懷在北京主持召開中央軍委擴大會議。本來會議的任務是部署全軍整風運動和研究軍隊整編問題，可是在會議開始后不久，參加或列席過訓練總監(jiān)部四級干部會議的人把訓練總監(jiān)部爭論的問題提了出來，從而使軍事訓練工作中該不該反對“教條主義”也變成了會議的一個主題。

　　6月9日，中央軍委秘書長黃克誠傳達毛澤東的指示，說他對會議的決心很大，如果開不好，大家就不要走，并決定把會議參加者的范圍擴大到師。6月20日，開全體會議，正式代表增加到1004人，列席代表438人。6月23日至29日期間，毛澤東到會講話。他說：“現(xiàn)在學校奇怪得很，中國革命戰(zhàn)爭經(jīng)驗不講，專門講'十大打擊'。而我們幾十個打擊也有，卻不講�！�…不知道軍事學院、訓總到底有多少馬克思列寧主義。”講話的末尾，他對劉伯承作了不適當?shù)脑u論。當主持會議的人向毛澤東反映說蕭克抵制反“教條主義”運動，拒不檢討時，毛澤東說蕭克是壞人，是資產(chǎn)階級隊伍里的人。