1986年，顧誦芬先生上調部科技委任副主任，主抓航空科技預研工作與對外技術交流，1988年，六院撤銷六年后，航空研究院再次成立，顧先生轉任副院長，至93年撤銷為止，這一段時間，在顧先生的卓越努力下，中國航空工業(yè)通過切實有效地預研，迅速縮小了與航空技術前沿的距離，取得一大批研究成果，積累大量技術儲備，為93年后中國航空工業(yè)的加速追趕奠定了扎實基礎。

　　早在1985年，601所超聲速巡航戰(zhàn)斗機布局預研課題便已立項，七五時期開始，601所更是作為組長單位，帶領國內廠所對先進戰(zhàn)斗機技術進行了長期跟蹤預研，李天院士連續(xù)20年擔任總裝先進氣動布局專項負責人，并長期主持國防科工委隱身技術預研專項。

　　在這兩項預研的成果基礎上，八五期間，601所主動提出并主持了綜合性更強的飛機總體綜合設計技術重大專項，九五期間，601所進一步帶領國內廠所開拓綜合飛力/推力控制，2000年即建成了綜合飛推半物理模擬實驗臺，2002年，601在國內主機所中首先建立起了專業(yè)的隱身設計隊伍，2011年，建成中國第一個隱身測試實驗室(國家重點實驗室)。

　　實驗能力提高的同時，601所等單位取得了一大批預研成果，包括二元紅外噴管、座艙風擋隱身鍍膜、等離子隱身、吸波材料，在經(jīng)費緊缺的情況下，1998年，以殲8II完成了中國第一次真機RCS外場測試，通過綜合措施，證實了改進設計可減少前向RCS達三分之二，成果已應用于殲8后續(xù)改型。李天院士發(fā)展的中國第一套隱身精確計算手段，以及由其主編，凝聚二十年研究成果的《隱身飛機設計指南》，為中國先進戰(zhàn)斗機的工程發(fā)展奠定了基礎。

　　艦載戰(zhàn)斗機技術方面，601所云夢東等老一代科研工作者未雨綢繆，早在1983年即開始了相關技術跟蹤預研，1987年完成了殲8II改艦載論證，89年后進一步完成了殲13改艦載機論證，海軍方面給予了極高的評價：“我們只有在601所看到了，看得見、摸得著的艦載機特種技術儲備。”

　　其后，沈飛在沒有訂貨沒有撥款的情況下，自籌資金果斷決策，引進了一架廢棄在烏克蘭的SU33原型機，為其后的自行設計奠定了堅實基礎。1989年，顧誦芬先生抓住稍縱即逝的機會，建立起與蘇聯(lián)方面的航空學術交流機制，顧先生牽頭發(fā)起的中俄空氣動力及強度學術會議，迄今以舉行了12屆，極大提高了中國空氣動力學基礎研究的水準與能力。

　　1991年，顧誦芬先生利用自己與中央流體動力院長比施根斯建立的友情，說服對方同意對中國的第四代戰(zhàn)斗機預研方案(背景機)進行評審，通過這次細致認真的評審，以及其后601所等方面利用這一窗口期從中央流體動力引進的大批軟件、資料，改變了我國背景機研制閉門造車的局面，使其由預研向工程發(fā)展陡然加速。